首先查明逾期未認(rèn)證原因，原因是否屬于國家稅務(wù)總局公告［2011］第050號《關(guān)于逾期增值稅扣稅憑證抵扣問題的公告》中客觀原因造成增值稅扣稅憑證逾期情形。

如果是就經(jīng)主管稅務(wù)機(jī)關(guān)審核、逐級上報，由國家稅務(wù)總局認(rèn)證、稽核比對后，對比對相符的增值稅扣稅憑證，會允許納稅人繼續(xù)抵扣其進(jìn)項稅額；如果不屬于客觀原因類型，那么是抵扣不了的。

根據(jù)國家稅務(wù)總局公告［2011］第050號《關(guān)于逾期增值稅扣稅憑證抵扣問題的公告》的規(guī)定：對增值稅一般納稅人發(fā)生真實交易但由于客觀原因造成增值稅扣稅憑證逾期的，經(jīng)主管稅務(wù)機(jī)關(guān)審核、逐級上報，由國家稅務(wù)總局認(rèn)證、稽核比對后，對比對相符的增值稅扣稅憑證，允許納稅人繼續(xù)抵扣其進(jìn)項稅額。增值稅一般納稅人由于除本公告第二條規(guī)定以外的其他原因造成增值稅扣稅憑證逾期的，仍應(yīng)按照增值稅扣稅憑證抵扣期限有關(guān)規(guī)定執(zhí)行。

客觀原因包括如下類型：

（一）因自然災(zāi)害、社會突發(fā)事件等不可抗力因素造成增值稅扣稅憑證逾期；

（二）增值稅扣稅憑證被盜、搶，或者因郵寄丟失、誤遞導(dǎo)致逾期；

（三）有關(guān)司法、行政機(jī)關(guān)在辦理業(yè)務(wù)或者檢查中，扣押增值稅扣稅憑證，納稅人不能正常履行申報義務(wù)，或者稅務(wù)機(jī)關(guān)信息系統(tǒng)、網(wǎng)絡(luò)故障，未能及時處理納稅人網(wǎng)上認(rèn)證數(shù)據(jù)等導(dǎo)致增值稅扣稅憑證逾期；

（四）買賣雙方因經(jīng)濟(jì)糾紛，未能及時傳遞增值稅扣稅憑證，或者納稅人變更納稅地點，注銷舊戶和重新辦理稅務(wù)登記的時間過長，導(dǎo)致增值稅扣稅憑證逾期,

（五）由于企業(yè)辦稅人員傷亡、突發(fā)危重疾病或者擅自離職，未能辦理交接手續(xù)，導(dǎo)致增值稅扣稅憑證逾期

（六）國家稅務(wù)總局規(guī)定的其他情形。